大正6年（1917）9月に雄物川の改修のため、旧内務省仙台土木出張所所属の「雄物川改修土地収用事務所」として、秋田市鍛冶町上川反（現秋田市旭南二丁目）に開設されました。
　その後、幾度かの統廃合を経て昭和27年5月に秋田工事事務所へ改められ、平成15年4月には秋田河川国道事務所に名称変更し現在に至ります。
　また、平成29年7月に発生した豪雨災害に対し、重点的な堤防整備等を円滑に進めるため、平成30年1月1日に「雄物川 激甚災害対策特別緊急事業推進室 秋田分室」が設置されました。